Die Geschäftsführung zeichnet verantwortlich für den gesamten geschäftsbetrieblichen Verwaltungsbereich, dazu gehören z. B. Rechnungswesen, Controlling und Personalwesen. Sie steht zudem in engem Austausch mit der jeweiligen Hochschulleitung und bildet die Schnittstelle zu den anderen Unternehmen der COGNOS Bildungsgruppe, einem Unternehmensverbund, bestehend aus national und international agierenden Hochschulen, Schulen, Akademien, Ausbildungs- und Trainingsinstituten, an den auch die Hochschule Fresenius angeschlossen ist.